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      nanoporetech 使用納米孔測序技術的微生物學

       更新時間:2021-02-08 點擊量:1109

       

       nanoporetech 使用納米孔測序技術的微生物學

      完整的細菌,真菌和病毒(DNA或RNA)基因組,可進行長時間的納米孔測序。通過快速的病原體檢測方法(無論是在實驗室還是在野外),從環境或單一生物樣品中鑒定并鑒定微生物。如果需要,還應附有抗菌素耐藥性分析。使用直接RNA或cDNA方法對全長轉錄本進行測序,以進行準確的基因表達和轉錄本亞型分析。

       
      • 通過長讀和超長讀來簡化從頭組裝并校正參考基因組
      • 解決結構變化和重復區域
      • 測序和定量全長轉錄本,以進行明確的基因表達和亞型分析
      • 通過直接測序消除偏倚并鑒定表觀遺傳修飾
      • 實時獲取結果,包括物種識別
      • 使用Flongle,MinION,GridION或PromethION擴展到您的需求

       

       

      全面分析微生物基因組(DNA或RNA)。準確定位重復區域和結構變異,并使用長測序讀數將質粒與基因組區分開。簡化從頭組裝并更正現有的參考基因組。可擴展以適應您從工作臺到現場的需求。

      • 準確解析具有挑戰性的基因組區域(結構變異和重復) 
      • 簡化從頭組裝和正確的參考基因組,長讀
      • 使用全基因組,靶向和多路復用方法
      • 無需PCR的直接DNA和RNA測序消除了偏倚
      • 通過實時數據流獲得即時結果
      • 可擴展以滿足您的需求-1.8 Gb Flongle;30 Gb MinION;150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

       

       

      實時準確識別微生物和相關的抗藥性(AMR)。Oxford Nanopore提供了完整的解決方案-從快速的10分鐘文庫制備(DNA)到使用EPI2ME平臺的實時系統發育和AMR分析。使用宏基因組或靶向16S rRNA方法。使用便攜式MinION或臺式GridION或PromethION設備在樣品源處或實驗室中進行測序。

      • 實時識別微生物和AMR,并通過長時間閱讀來區分密切相關的菌株
      • 快速的全基因組或靶向(例如16S)方法簡化了工作流程
      • 使用便攜式MinION和Flongle在樣品源處進行測序
      • 多重樣品獲得更具成本效益的結果
      • 可擴展以滿足您的需求-1.8 Gb Flongle;30 Gb MinION;150 Gb GridION; 4,800 / 9,600 Gb PromethION P24 / P48

       

      使用全長納米孔測序讀數,解析轉錄本亞型并測量真實的基因表達譜。低投入量與快速,簡化的工作流程相結合,可進行高度敏感的基因表達分析

      • 測序完整的全長轉錄本,以明確鑒定轉錄本亞型
      • 準確定量同工型以進行敏感的基因表達分析
      • 使用直接cDNA或直接RNA測序消除PCR偏倚
      • 輕松識別反義轉錄本和lncRNA亞型
      • 新增功能:使用更新的RNA和cDNA測序試劑盒,只需較少的投入即可獲得更高的產量

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      微生物表現出許多類型的堿基修飾,可影響一系列功能,包括基因表達和抗菌素耐藥性。與基于替代測序的分析方法不同,納米孔測序不需要擴增或鏈合成,可以減少偏差并保留修飾的堿基信息,這些信息可以與核苷酸序列一起直接檢測到-無需額外的樣品轉換。 

      • 在一次測定中鑒定修飾的堿基和核苷酸序列
      • 將基本修改記錄為標準-準備就緒時進行分析
      • 使用無PCR的全基因組,全轉錄組或靶向測序方法
      • 使用核苷酸類似物探索基因組復制
      • 快速的10分鐘文庫制備(DNA)-不需要亞硫酸氫鹽或化學轉化
      • 使用越來越多的工具來分析數據

       

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